Studentische oder Wissenschaftliche Hilfskräfte (WHK / WHB) (m/w/d) zur Unterstützung der Medizinischen Bioinformatik - Bochum

Zur Unterstützung unseres Teams suchen wir zwei studentische Hilfskräfte (SHK) oder wissenschaftliche Hilfskraft mit Bachelor-Abschluss (WHB) - beide Positionen können jeweils als SHK oder WHB besetzt werden (je nach derzeitigem Studienstatus), mit 8 Std./Woche.

Wer wir sind

Die Medizinische Bioinformatik an der Ruhr-Universität Bochum untersucht unterschiedlichste Omics-Daten (Genomik, Transkriptomik, Proteomik), sowie deren Integration - wobei Ansätze der Präzisionsmedizin, diverse Biomarker-Identifikationsworkflows und Machine Learning zur Anwendung kommen. Teile der Gruppe gehören zur Core Unit Bioinformatik der Medizinischen Fakultät - CUBiMed.RUB, die Wissenschaftler:innen der Lebenswissenschaften mit Beratung, Analysen sowie eigener Software und reproduzierbaren Nextflow-Workflows unterstützt. Hierbei haben wir auch Zugriff auf einen eigenen Compute-Cluster im Datacenter der RUB.

Deine Aufgaben

• Mitarbeit bei der Entwicklung von Tools, Modulen und (reproduzierbaren) Workflows, z. B. mit Nextflow / nf-core

• Unterstützung bei der Auswertung und Analyse (bio-)medizinischer Omics-Daten im Rahmen von Beratungs- und Serviceanfragen der CUBiMed.RUB

• Testen, Benchmarken und Dokumentieren von Tools und Workflows

Welche Schwerpunkte du übernimmst, richten wir an deinen Interessen und Vorkenntnissen aus.

Dein Profil

Du bringst mindestens einen der folgenden Punkte mit:

• Programmierkenntnisse (Python, R, Rust oder C/C++)

• Grundkenntnisse in Statistik (von Omics-Daten)

Außerdem natürlich Neugier, Zuverlässigkeit, Computer-Affinität und eine selbstständige Arbeitsweise

Von Vorteil sind außerdem:

• Erfahrung im Umgang mit Linux-Systemen (SSH und Terminal)

• Erfahrung mit Workflow-Systemen (Nextflow, Snakemake)

• Containerisierung von Anwendungen

• Kenntnisse in der Bioinformatik (Transkriptomik, Genomik, Proteomik)

• Kenntnisse in R und/oder Python (Datenanalyse, Statistik, Visualisierung)

• Kenntnisse in einer höheren Programmiersprache (Entwicklung effizienter Tools)

Dies wird nicht alles vorausgesetzt: Wenn du einen Teil davon mitbringst und Lust hast, dich in den Rest einzuarbeiten, freuen wir uns über deine Bewerbung.

Wir bieten

• Mitarbeit in einem kollegialen Bioinformatik-Team

• Arbeitsplatz an der RUB (Campus), anteilig Homeoffice möglich

• Spannende, medizin-bioinformatische Aufgaben mit echtem Forschungsbezug

• Zugang zu leistungsfähiger High-Performance-Infrastruktur

• Die Möglichkeit, praktische Erfahrung zu sammeln und deine Kenntnisse in Programmierung, Datenanalyse und Bioinformatik weiter auszubauen

• Vergütung nach der Pauschale für Hilfskräfte der Ruhr-Universität Bochum

Bewerbung

Wir freuen uns auf deine Bewerbung (kurzes Anschreiben, Lebenslauf, ggf. aktueller Notenspiegel) per E-Mail.