Zur Unterstützung unseres Teams suchen wir zwei studentische Hilfskräfte (SHK) oder wissenschaftliche Hilfskraft mit Bachelor-Abschluss (WHB) - beide Positionen können jeweils als SHK oder WHB besetzt werden (je nach derzeitigem Studienstatus), mit 8 Std./Woche.

Wer wir sind

Die Medizinische Bioinformatik an der Ruhr-Universität Bochum untersucht unterschiedlichste Omics-Daten (Genomik, Transkriptomik, Proteomik), sowie deren Integration - wobei Ansätze der Präzisionsmedizin, diverse Biomarker-Identifikationsworkflows und Machine Learning zur Anwendung kommen. Teile der Gruppe gehören zur Core Unit Bioinformatik der Medizinischen Fakultät - CUBiMed.RUB, die Wissenschaftler:innen der Lebenswissenschaften mit Beratung, Analysen sowie eigener Software und reproduzierbaren Nextflow-Workflows unterstützt. Hierbei haben wir auch Zugriff auf einen eigenen Compute-Cluster im Datacenter der RUB.

Deine Aufgaben

Mitarbeit bei der Entwicklung von Tools, Modulen und (reproduzierbaren) Workflows, z. B. mit Nextflow / nf-core
Unterstützung bei der Auswertung und Analyse (bio-)medizinischer Omics-Daten im Rahmen von Beratungs- und Serviceanfragen der CUBiMed.RUB
Testen, Benchmarken und Dokumentieren von Tools und Workflows

Welche Schwerpunkte du übernimmst, richten wir an deinen Interessen und Vorkenntnissen aus.

Dein Profil

Du bringst mindestens einen der folgenden Punkte mit:

Programmierkenntnisse (Python, R, Rust oder C/C++)
Grundkenntnisse in Statistik (von Omics-Daten)

Außerdem natürlich Neugier, Zuverlässigkeit, Computer-Affinität und eine selbstständige Arbeitsweise

Von Vorteil sind außerdem:

Erfahrung im Umgang mit Linux-Systemen (SSH und Terminal)
Erfahrung mit Workflow-Systemen (Nextflow, Snakemake)
Containerisierung von Anwendungen
Kenntnisse in der Bioinformatik (Transkriptomik, Genomik, Proteomik)
Kenntnisse in R und/oder Python (Datenanalyse, Statistik, Visualisierung)
Kenntnisse in einer höheren Programmiersprache (Entwicklung effizienter Tools)

Dies wird nicht alles vorausgesetzt: Wenn du einen Teil davon mitbringst und Lust hast, dich in den Rest einzuarbeiten, freuen wir uns über deine Bewerbung.

Wir bieten

Mitarbeit in einem kollegialen Bioinformatik-Team
Arbeitsplatz an der RUB (Campus), anteilig Homeoffice möglich
Spannende, medizin-bioinformatische Aufgaben mit echtem Forschungsbezug
Zugang zu leistungsfähiger High-Performance-Infrastruktur
Die Möglichkeit, praktische Erfahrung zu sammeln und deine Kenntnisse in Programmierung, Datenanalyse und Bioinformatik weiter auszubauen
Vergütung nach der Pauschale für Hilfskräfte der Ruhr-Universität Bochum

Bewerbung

Wir freuen uns auf deine Bewerbung (kurzes Anschreiben, Lebenslauf, ggf. aktueller Notenspiegel) per E-Mail.

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