Im Institut für KI i.d. Medizin i.d. Gruppe für Data Science and Microbiome Analysis wird ein/e MasterstudentIn gesucht. - Duisburg-Essen
Dein Job
Im Institut für Künstliche Intelligenz in der Medizin in der Gruppe für Data Science and Microbiome Analysis (Prof. Dr. Folker Meyer) wird zum nächstmöglichen Zeitpunkt ein/e MasterstudentIn im Bereich Bioinformatik gesucht.
Das Institut für Künstliche Intelligenz in der Medizin (IKIM) bildet die Schnittstelle zwischen dem Universitätsklinikum Essen und der biologischen/informatischen Forschung. Unser Aufgabenbereich umfasst sowohl die Datengenerierung mittels modernster Sequenziermethoden für Forschung, Entwicklung und Diagnostik im medizinischen und umweltbezogenen Kontext als auch die Entwicklung und Anwendung von Softwarelösungen zur Analyse dieser Daten.
Thema Masterarbeit
Im Rahmen einer Masterarbeit arbeitest Du an der Schnittstelle von Mikrobiologie, Bioinformatik und Machine Learning. Die Arbeit umfasst die Analyse von Sequenzdaten generiert aus Patientenproben, die Aufbereitung und Integration von Antibiotikaresistenzdaten sowie die Entwicklung und Evaluation von Modellen zur Vorhersage von Antibiotikaresistenzen. Ein besonderer Fokus liegt auf der Vorhersage von Resistenzen aus Mischproben, wie sie in der klinischen Praxis häufig auftreten.
Dein Profil
Qualifikationsprofil
- MasterstudentIn der Molekularbiologie, Bioinformatik, Biochemie, Informatik oder eines angrenzenden Gebiets
- Fähigkeit zum selbstständigen und strukturierten Arbeiten
- Hohes Maß an Einsatzbereitschaft, Flexibilität und Teamfähigkeit
- Interesse an Mikrobiologie, Genomik und datengetriebener Medizin
Wünschenswerte Kenntnisse und Fähigkeiten
Die folgenden Kenntnisse sind von Vorteil, aber keine Voraussetzung. Auch BewerberInnen, die nur einzelne Punkte abdecken oder sich in diese Themen einarbeiten möchten, sind ausdrücklich eingeladen, sich zu bewerben:
- Grundkenntnisse in Programmierung mit Python
- Erste Erfahrungen mit Linux/Unix (Bash)
- Grundlegender Umgang mit Git oder anderen Versionsverwaltungssystemen
- Grundverständnis von Whole Genome Sequencing
- Grundverständnis von Machine Learning
Deine Benefits
Stellenmerkmale
Dein Beschäftigungsumfang
Teilzeit (befristet)
Dein Gehalt
Nach Vereinbarung
Dein Arbeitsplatz:
z.T. im Homeoffice
Dein Büro:
Raum Duisburg-Essen