Im Institut für KI i.d. Medizin i.d. Gruppe für Data Science and Microbiome Analysis ein/e MasterstudentIn gesucht. - Duisburg-Essen

Universität Duisburg-Essen
Raum Duisburg-Essen
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Dein Job

In diesem Projekt beschäftigst du dich mit der Auswertung umfangreicher Mikrobiom-Datensätze, darunter Shotgun-Metagenomik und 16S-rRNAGensequenzierung. Die Daten stammen aus verschiedenen Zeitpunkten und Versuchsbedingungen und eröffnen spannende Einblicke in die Dynamik mikrobieller Gemeinschaften. Ziel der Arbeit ist es, über rein beschreibende Auswertungen hinauszugehen und Modelle zu entwickeln, die helfen, Muster, Zusammenhänge und Veränderungen im Mikrobiom besser zu verstehen und biologisch einzuordnen.

Die Masterarbeit ist interdisziplinär angelegt und verbindet Mikrobiologie, Bioinformatik und moderne Methoden des Machine Learnings. Du arbeitest mit realen, komplexen Datensätzen und lernst, wie prädiktive Modelle für Mikrobiomdaten entwickelt, sorgfältig validiert und interpretiert werden. Ein besonderer Fokus liegt darauf, zeitliche Veränderungen mikrobieller Gemeinschaften abzubilden und die biologischen Treiber hinter Modellentscheidungen nachvollziehbar zu machen. Dabei erwirbst du praxisnahe Kompetenzen, die sowohl für eine wissenschaftliche Laufbahn als auch für datengetriebene Tätigkeiten in anderen Bereichen relevant sind. 

 

Dein Profil

Qualifikationsprofil

  • MasterstudentIn der Bioinformatik, Computergestützte Biologie, Datenwissenschaft, Statistik, Informatik oder eines angrenzenden Gebiets
  • Grundkenntnisse in Programmierung und Machine Learning
  • Fähigkeit zum selbstständigen und strukturierten Arbeiten
  • Hohes Maß an Einsatzbereitschaft, Flexibilität und Teamfähigkeit
  • Interesse an Mikrobiologie, Genomik und datengetriebener Biologie

 

Wünschenswerte Kenntnisse und Fähigkeiten

 

Die folgenden Kenntnisse sind von Vorteil, aber keine Voraussetzung. Auch

 

BewerberInnen, die nur einzelne Punkte abdecken oder sich in diese Themen

 

einarbeiten möchten, sind ausdrücklich eingeladen, sich zu bewerben: 
• Erweiterte Erfahrung in Programmierung mit Python und Bash

 

• Sicherer Umgang mit Linux/Unix

 

• Grundlegender Umgang mit Git oder anderen Versionsverwaltungssystemen

 

• Grundverständnis von Mikrobiomdatenanalyse (16S und/oder Metagenomik) 
 

Deine Benefits

Flexible Arbeitszeit

Stellenmerkmale

Dein Beschäftigungsumfang

Teilzeit (befristet)

Dein Gehalt

Nach Vereinbarung

Dein Arbeitsplatz:

z.T. im Homeoffice

Dein Büro:

Raum Duisburg-Essen

Ansprechpartner:in

Bei Fragen

Frau Kerstin Bornemann