
In diesem Projekt beschäftigst du dich mit der Auswertung umfangreicher Mikrobiom-Datensätze, darunter Shotgun-Metagenomik und 16S-rRNAGensequenzierung. Die Daten stammen aus verschiedenen Zeitpunkten und Versuchsbedingungen und eröffnen spannende Einblicke in die Dynamik mikrobieller Gemeinschaften. Ziel der Arbeit ist es, über rein beschreibende Auswertungen hinauszugehen und Modelle zu entwickeln, die helfen, Muster, Zusammenhänge und Veränderungen im Mikrobiom besser zu verstehen und biologisch einzuordnen.
Die Masterarbeit ist interdisziplinär angelegt und verbindet Mikrobiologie, Bioinformatik und moderne Methoden des Machine Learnings. Du arbeitest mit realen, komplexen Datensätzen und lernst, wie prädiktive Modelle für Mikrobiomdaten entwickelt, sorgfältig validiert und interpretiert werden. Ein besonderer Fokus liegt darauf, zeitliche Veränderungen mikrobieller Gemeinschaften abzubilden und die biologischen Treiber hinter Modellentscheidungen nachvollziehbar zu machen. Dabei erwirbst du praxisnahe Kompetenzen, die sowohl für eine wissenschaftliche Laufbahn als auch für datengetriebene Tätigkeiten in anderen Bereichen relevant sind.
Qualifikationsprofil
Wünschenswerte Kenntnisse und Fähigkeiten
Die folgenden Kenntnisse sind von Vorteil, aber keine Voraussetzung. Auch
BewerberInnen, die nur einzelne Punkte abdecken oder sich in diese Themen
einarbeiten möchten, sind ausdrücklich eingeladen, sich zu bewerben:
• Erweiterte Erfahrung in Programmierung mit Python und Bash
• Sicherer Umgang mit Linux/Unix
• Grundlegender Umgang mit Git oder anderen Versionsverwaltungssystemen
• Grundverständnis von Mikrobiomdatenanalyse (16S und/oder Metagenomik)
Stellenmerkmale
Dein Beschäftigungsumfang
Teilzeit (befristet)
Dein Gehalt
Nach Vereinbarung
Dein Arbeitsplatz:
z.T. im Homeoffice
Dein Büro:
Raum Duisburg-Essen